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Acte - DCC 2026 009 06 Annexe DCC 2026 009PJ6 Validatio
Acte - DCC 2026 008 01 Annexe DCC 2026 008PJ Validation
Acte - DCC 2025 124 01 Annexe DCC 2025 124 Z PJ Rappo
Déliberation - DCC 2025 066 01 Annexe DCC 2025 066PJ1 Delib app
Acte - DCC 2025 067 01 Annexe DCC 2025 067PJ RPQS Eau 2
Acte - DCC 2026 012 06 Annexe DCC 2026 012PJ6 Interet g
Acte - DCC 2026 009 04 Annexe DCC 2026 009PJ4 Validation du PCAET
Document publié le Samedi 7 mars 2026 à 03h44 par la commune de Lons-le-Saunier.
Lien du pdf (Acte - DCC 2026 009 04 Annexe DCC 2026 009PJ4 Validation du PCAET)
Thèmes du document : Environnement, Eau et assainissement, Changement climatique,
| Cä #
EC y :\
— Lons Agglo ——
Accusé de réception - Ministère de l'Intérieur
(039-200071 116-20260205-DCC-2026-009-DE
Accusé certifié exécutoire
[Réception par le préfet : 10/02/2026
Espace communautaire de Lons Agglomération
Janvier 2026
Plan Climat Air Énergie Territorial
État Initial de l’Environnement
Espace Communautaire Lons
Agglomération MOSAÏQUE
C ENVIRONNEMENT Évaluation Stratégique
OPOiBi
CERTIFICAT
LM 1312 2653
ÉTAT INITIAL DE L’ENVIRONNEMENT – PCAET
Mosaïque Environnement – 2025 P a g e | 1
Cet état initial de l’environnement constitue une synthèse de l’EIE produit dans le cadre du PLUi de
l’Espace Communautaire de Lons Agglomération et du SCoT du Pays Lédonien, dans un souci
d’optimisation des productions, dans un délai rapproché et sur des données identiques. Certains
éléments ont pu être complétés.
Rédaction : LUQUET Tomi ; DUBOIS Estelle
Cartographie : DUBOIS Estelle
Agence Mosaïque Environnement
111 rue du 1er Mars 1943 - 69100 Villeurbanne tél. 04.78.03.18.18 - fax 04.78.03.71.51
agence@mosaique-environnement.com - www.mosaique-environnement.com
SCOP à capital variable – RCS 418 353 439 LYON ÉTAT INITIAL DE L’ENVIRONNEMENT – PCAET
Mosaïque Environnement – 2025 P a g e | 2
Table des matières
1 Contexte territorial ............................................................................................ 3
1.1 En synthèse ............................................................................................................................................... 3
1.1.1 Le territoire et l’évolution du climat ........................................................................................... 4
1.1.2 Le paysage et la santé ................................................................................................................ 4
1.1.3 Enjeux et scénario au fil de l’eau ............................................................................................... 5
2 Paysage et patrimoine ..................................................................................... 8
1.1 En synthèse ............................................................................................................................................... 8
2.1.1 Le paysage et le climat ............................................................................................................... 9
2.1.2 Enjeux et scénario au fil de l’eau ............................................................................................... 9
3 Biodiversité et milieux naturels ...................................................................... 12
3.1 En synthèse ............................................................................................................................................. 12
3.1.1 La biodiversité et le climat ........................................................................................................ 13
3.1.2 La biodiversité et la santé.......................................................................................................... 13
3.1.3 Enjeux et fil de l’eau ................................................................................................................... 14
4 La ressource en eau et les milieux aquatiques............................................ 17
4.1 En synthèse ............................................................................................................................................. 17
4.1.1 La ressource en eau et le climat .............................................................................................. 18
4.1.2 Ressource en eau et santé........................................................................................................ 19
4.1.3 Enjeux et fil de l’eau ................................................................................................................... 19
5 Risques naturels et technologiques ............................................................... 23
5.1 En synthèse ............................................................................................................................................. 23
5.1.1 Les risques majeurs et le climat ................................................................................................. 24
5.1.2 Risques majeurs et santé ........................................................................................................... 25
5.1.3 Enjeux et fil de l’eau ................................................................................................................... 25
6 Nuisance et pollutions .................................................................................... 28
6.1 En synthèse ............................................................................................................................................. 28
6.1.1 Les nuisances et pollutions et le climat .................................................................................... 28
6.1.2 Nuisances, pollutions et santé ................................................................................................... 29
6.1.3 Enjeux et fil de l’eau ................................................................................................................... 30
Synthèse des enjeux du territoire ..................................................................................... 33
Table des cartes
Carte 1 : Occupation des sols et enjeux .......................................................................................................... 6 Carte 2 : Enjeux paysagers et patrimoniaux .................................................................................................. 10 Carte 3 : Enjeux de biodiversité ....................................................................................................................... 15 Carte 4 : Enjeux de la ressource en eau ........................................................................................................ 21 Carte 5 : Enjeux et gestion des risques ........................................................................................................... 26 Carte 6 : Enjeux de réduction des nuisances ................................................................................................ 31 ÉTAT INITIAL DE L’ENVIRONNEMENT – PCAET
1 Contexte territorial
1.1 En synthèse
Créée le 1er janvier 2012, l’Espace Communautaire Lons Agglomération (ECLA) regroupait initiale-
ment 23 communes. Au fil du temps, des communes ont rejoint ou quitté ECLA, notamment suite à la
fusion avec la Communauté de communes du Val de Sorne. Aujourd’hui, le périmètre d’ECLA
s’étend sur 32 communes, intégrant Baume-les-Messieurs depuis le 1er janvier 2019.
Situé au cœur du département du Jura, la forêt domine le paysage. Les grandes cultures et les vignes
font également partie du paysage du territoire. Les paysages ouverts, dominés par les prairies, repré -
sentent également une part importante de l’occupation des sols.
Géologiquement, le territoire repose sur des formations de sables, argiles, calcaires et marnes :
• à l’Ouest, un socle composé de sables et d’alluvions, sur la plaine Bresse Comtoise ;
• au Centre, une forte présence d’argiles et de marnes ainsi que quelques formations calcaires sur la
Bordure Jurassienne, entité de transition de la plaine au Premier Plateau, et des calcaires massifs et
compacts au Centre-Sud au passage à la Petite Montagne ;
• à l’Est, des formations calcaires, caractéristiques du Premier Plateau. La formation du massif du Jura
explique ces variations marquées, avec un dépôt sédimentaire suivi par des mouvements tecto -
niques qui ont généré des plis et des chevauchements, qui sont l’origine des alternances de roches
sur le territoire.
Cette diversité influence l’usage des sols : l’imperméabilité des argiles favorise la présence d’eau, les
sols marneux sont fertiles pour l’agriculture, et la diversité des roches se traduit dans l’architecture lo -
cale.
Le climat est de type semi-continental, avec des hivers froids et humides, des étés tempérés à chauds
et une pluviométrie importante toute l’année. L’influence montagnarde engendre des variations cli -
matiques et favorise certaines cultures, comme la vigne.
La seule carrière en activité, Bois du Roi, exploite des roches massives de calcaires et les concasse
afin de produire des granulats.
Concernant l’occupation du sol, ECLA est un territoire caractérisé par un paysage rural dominé par
des forêts, des prairies et des cultures agricoles avec un centre urbain diffus autour de Lons-le-Saunier,
le centre-bourg et « capitale » du département du Jura. Plusieurs zones urbaines sont parsemées au
sein des communes. Le territoire d’ECLA possède un paysage de milieux naturels fort, dominé par les
milieux boisés et les milieux ouverts.
L’espace agricole est marqué par un fort potentiel agronomique, notamment grâce à la diversité
géologique et des sols, qui offre la possibilité de mettre en place une multitude d’activités agricoles,
de la viticulture sur les coteaux jusqu’à l’agriculture extensive en plaine en passant par le pâturage
sur les plateaux.
Atouts Faiblesses
o Une forte présence des espaces agricoles
et naturels
o Un contexte géologique et géographique
riche et varié
o Enfrichement des cultures agricoles et des
prairies
o Un contexte géographique qui rend
l’espace urbanisé concentré autours des
milieux aquatiques et donc sensible aux
Mosaïque Environnement – 2025 P a g e | 3 ÉTAT INITIAL DE L’ENVIRONNEMENT – PCAET
o Un patrimoine géologique fort et
structurant le territoire et ses activités
o Un ralentissement de la consommation
foncière
risques d’inondations
1.1.1 Le territoire et l’évolution du climat
Sur les espaces agricoles, les évolutions climatiques risquent d’entrainer une évolution des indicateurs
agro-climatiques (dates de récolte, nombre de jours chauds) et une augmentation de la variabilité
des rendements et de la qualité des récoltes, suites aux vagues de chaleur et au stress hydrique, mais
également au gel tardif ou aux épisodes de grêle dont le risque ne diminue pas malgré la diminution
du nombre de jours de gel par an. L’émergence de ravageurs est très probable, par la hausse des
températures estivales. L’augmentation des besoins en eau et l’aggravation du stress thermique sur
l’élevage pourront également être des conséquences notables.
Afin de s’y préparer, le maintien du bocage ainsi que le choix de variétés plus précoces et/ou plus ré -
sistantes aux températures élevées sont des facteurs de résilience.
Le contexte paysagé, marqué par de forte variabilité de topographie et la diversité des sols du terri -
toire joue un rôle certain sur la diversité de climat observé sur le territoire. Dans les communes de la
plaine de la Bresse, la présence d’espaces agricoles alliant prairie et culture diverses, permet de limi -
ter les impacts et est bénéfique pour l’adaptation au changement climatique. Notons toutefois
qu’en lien avec le dérèglement climatique, les espaces agricoles, asséchés par l’augmentation
moyenne des températures, pourraient ne plus jouer ce rôle. Enfin, la présence de haies bocagères
peut avoir un bénéfice sur l’adaptation des espaces agricoles. Les superficies toujours en herbe res -
tent les principales surfaces agricoles sur le territoire, et représentent 80% des surfaces en 2021 avec
même un renforcement des prairies permanentes et un développement sensible des estives et sur -
faces fourragères alors qu’à l’inverse, les superficies en grandes cultures tendent à diminuer, en parti-
culier dans les secteurs de la Bresse et du vignoble du Jura.
1.1.2 Le paysage et la santé
La santé des occupants et utilisateurs des bâtiments constitue une attente croissante de la société et
une préoccupation majeure des pouvoirs publics. Le bâtiment est en effet porteur d’une valeur sym-
bolique forte de protection et de refuge. La veille scientifique et technique dans le domaine du bâti-
ment et la veille sanitaire ont conduit à détecter des sources et conditions de pollution présentant
des risques pour la santé.
En particulier pour le territoire de l’Espace Communautaire de Lons Agglomération, les bâtiments an -
ciens typiques des territoires de montagne, souvent en pierre et bois, nécessitent une attention parti-
culière lors des rénovations pour prévenir des risques sanitaires liés à l’amiante, au plomb ou au ra-
don, souvent accentués par les conditions climatiques (froid, humidité).
Le patrimoine bâti montagnard joue un rôle important dans le bien-être des habitants, offrant un
cadre propice aux échanges sociaux et au développement, notamment pour les enfants. Les quali-
tés intérieures (volume, acoustique, éclairage, matériaux) sont essentielles pour un environnement
sain et agréable, renforçant indirectement le sentiment de bien-être.
Mosaïque Environnement – 2025 P a g e | 4 ÉTAT INITIAL DE L’ENVIRONNEMENT – PCAET
1.1.3 Enjeux et scénario au fil de l’eau
Enjeux Priorité État actuel Tendance Facteurs d’évolution
La maîtrise de la consommation d’espaces
naturels et agricoles et la limitation de
l’étalement urbain, à travers le
renouvellement urbain et les efforts de
densification.
Pour préserver les activités économiques en place et
en particulier l’activité agricole, la biodiversité et la
qualité du cadre de vie sur le territoire, protéger les
abords des captages, et maintenir les capacités de
stockage de carbone du territoire
Loi Climat et Résilience et objectif de Zéro
Artificialisation Nette
Politique nationale de reconquête des friches
Effets du changement climatique sur l’agriculture
et la forêt
Ralentissement de la consommation d’espaces
agricoles pour la grande culture
Programmes & Stratégies en cours, contribuant à
répondre aux enjeux :
SCoT et PLUi en cours d’élaboration
La satisfaction des besoins en matériaux
(d’extraction, biosourcés, etc.) pour les
projets de rénovation et construction, sur
le long terme, privilégiant le principe de
proximité :
Limiter les flux et nuisances associées liées au
transport de matériaux en réduisant les distances
parcourues et en promouvant des modes de
transports alternatifs pour limiter les émissions de
GES et la consommation d’énergies fossiles qui y sont
liées.
Anticiper les besoins en matériaux en lien avec la
fermeture future de la carrière du territoire
Valoriser les potentiels de réemploi des sites après
exploitation (agriculture, valorisation des déchets
inertes …)
Le développement de filières de recyclage
de matériaux, notamment en lien avec le
renouvellement urbain (déconstruction,
réemploi)
Valoriser les ressources locales en bois, paille, terre,
pour contribuer à limiter l’épuisement des
ressources.
Poursuivre la dynamique locale autour de l’économie
circulaire pour valoriser la consommation de
construction de matériaux issus du réemploi, et.
Carrières actuelles en capacité de répondre aux
besoins (SCoT) à moyen terme et à hauteur de 73%
des besoins
Schéma Régional des carrières du Jura en place
depuis 2005
Absence de filière forte et structurée localement
sur les matériaux biosourcés
Effets du changement climatique sur les filières de
matériaux biosourcés (bois, paille, etc.)
Absence de filière forte et structurée localement
sur le réemploi ou recyclage des matériaux de
déconstruction
Programmes & Stratégies en cours, contribuant à
répondre aux enjeux :
Schéma Régional des Carrières en cours
d’élaboration depuis 2021
Démarche ECi locale
Mosaïque Environnement – 2025 P a g e | 5 Enjeux d'occupation des sols
Une pression foncière qui ralentit, mais qui agit EM Des espaces forestiers importants, concentrés au détriment des espaces agricoles, impactantles puits de sur les reliefs, puits de carbone, marqueurs du carbone, la qualité des sols et la gestion des eaux pluviales. paysage et ressource locale.
Une production de matériaux minériaux locale et _ Un espace agricole dominé par les prairies et l'élevage une ressource biosourcée, avec une dynamique laitier, maillé par un bocage, et fournisseur locale autour de l'économie circulaire. de productions à forte valeur ajoutées (AOP, vins),
Un relief et des entités géomorphologiques contrastés, mais sensible face au changement climatique.
structurant l'occupation de l'espace et l'usage des sols
Source : OSCGE 2017
Fond : © Contributeurs d'OpenStréetMap
Réalisation : 19/01/2026 -TL
Echelle :
À an CZ MOSAÏQUE
0 1 2km : ENVIRONNEMENT > Évaluation environementale du PCAET / Conseil & Expertise Espace Communautaire Lons Agglomération (39)
ÉTAT INITIAL DE L’ENVIRONNEMENT – PCAET
Carte 1 : Occupation des sols et enjeux
Mosaïque Environnement – 2025 P a g e | 6 ÉTAT INITIAL DE L’ENVIRONNEMENT – PCAET
1.1.3.1.1 A retenir :
L’espace communautaire de Lons Agglomération a une dynamique modérée, avec une priorisation
dans la consommation d’espace orientée vers les centres bourgs. On constate également une dimi-
nution importante du rythme de consommation d’espace sur le territoire par rapport à la période
2011 – 2021, et une tendance à l’enfrichement des espaces agricoles en particulier ceux initialement
destinés à la culture. Cet enherbement progressif dû à une déprise agricole favorise la séquestration
carbone. Cette tendance est également vectrice de résilience face au changement climatique, en
permettant aux sols de retrouver des fonctions naturelles (infiltration, support de biodiversité, rafrai -
chissement, etc.).
L’espace agricole sur le territoire se caractérise par un potentiel agronomique important, notamment
du fait de la diversité des sols et des contextes. Le maintien et la valorisation de cette diversité, ainsi
que l’adaptation au changement climatique de l’activité agricole sont donc indispensables pour la
pérennité de l’activité du territoire.
ENJEUX : La maîtrise de la consommation d’espaces naturels et agricoles et la limitation de l’étale -
ment urbain, à travers le renouvellement urbain et les efforts de densification.
Le contexte du territoire peut également contribuer à répondre à la demande en approvisionne-
ment en matériaux de construction grâce à l’exploitation de la carrière du Bois du Roi qui produit des
granulats, mais également créer une offre de matériaux biosourcés locale : paille, chanvre, bois, etc.,
permettant de limiter l’impact de la demande sur la ressource de calcaire et de limiter l’impact sur
les cours d’eau et les nappes phréatiques lié à l’extraction. Offre à laquelle les espaces boisés, pré-
sents sur une large partie du territoire, peuvent également contribuer (bois d’œuvre), sous condition
de pratiques sylvicoles durables, permettant la préservation de la capacité de séquestration de car-
bone. Cette dynamique d’approvisionnement en matériaux doit prendre place dans un contexte de
coopération et d’échanges avec les territoires voisins, d’autant plus que le SCoT du Pays Lédonien
nous informe que le bassin d’emplois de la zone de Lons-le-Saunier utilise déjà 73% des capacités po-
tentielles du territoire pour la production, et en exporte une partie vers la Suisse.
ENJEUX : La satisfaction des besoins en matériaux (d’extraction, biosourcés, etc.) pour les projets de
rénovation et construction, sur le long terme, privilégiant le principe de proximité et le développe -
ment de filières de recyclage de matériaux, notamment en lien avec le renouvellement urbain (dé-
construction, réemploi)
Mosaïque Environnement – 2025 P a g e | 7 ÉTAT INITIAL DE L’ENVIRONNEMENT – PCAET
2 Paysage et patrimoine
1.1 En synthèse
Le territoire de la collectivité est caractérisé par l’eau, concentrée à l’ouest, et le relief qui sont des
fondements très importants. Trois ensembles de relief se distinguent : la plaine, les plateaux, et les
montagnes offrant au territoire des perceptions paysagères multiples et créant des ambiances pay-
sagères contrastées.
La qualité des paysages tient aussi à la diversité des modes d’occupation des sols. Différentes struc -
tures sont ainsi présentes selon les secteurs et structurent les activités du territoire :
En plaine, l’agriculture extensive traditionnelle sur de larges surfaces prédomine. Le centre du terri -
toire comporte de la vigne sur les coteaux mêlée à des surfaces agricoles un peu plus complexes
que dans la plaine,
Sur les plateaux, le pâturage avec des systèmes bocagers est prédominant, ainsi que la forêt à majo -
rité de feuillus. Dans la montagne, ces systèmes bocagers sont cependant plus morcelés que sur les
plateaux.
Le maintien du bocage, des espaces forestiers et de la diversité agricole est donc un enjeu paysager
mais également un enjeu écologique, en lien avec l’impact sur la trame verte et bleue qui participe
à la résilience du territoire. Par ailleurs, les cours d’eau sont des vecteurs des petits et des grands pay -
sages. Leur risque d’assèchement induirait une dégradation paysagère et écologique.
Concernant le patrimoine, ECLA possède une identité patrimoniale riche et singulière, en particulier
concernant le patrimoine naturel et paysager. Les nombreuses reculées et formations géologiques
particulières sont remarquables et vecteur de tourisme, en particulier la reculée de Beaume-les-Mes-
sieurs, source de patrimoine identitaire et bénéficiant de nombreux statuts (ZNIEFF, Natura 2000, APPB,
Sites classés, CEN). Ses statuts et son rôle patrimonial en font un site à enjeux multiples, liés au pay -
sage patrimonial, aux milieux naturels ainsi qu’à l’activité économique et touristique du territoire.
Le territoire est également marqué par un riche patrimoine bâti et culturel, notamment des villages
traditionnels et des traces d’usages anciens liés à la gestion de l’eau et du relief, qui renforcent l’iden-
tité locale. La biodiversité y est remarquable, avec des espèces végétales et animales typiques des
milieux bocagers, forestiers et humides, qui profitent de la connectivité assurée par la trame verte et
bleue. Par ailleurs, les conditions climatiques locales, influencées par l’exposition des versants et l’alti -
tude, modulent les pratiques agricoles et façonnent les ambiances paysagères. L’équilibre entre acti-
vités agricoles, forestières, touristiques et urbanisation croissante constitue un enjeu fort pour la préser-
vation de la qualité paysagère et écologique du territoire. Enfin, les politiques locales s’orientent vers
une gestion durable des paysages, intégrant la restauration des milieux naturels et la prévention des
risques liés aux changements globaux, afin d’assurer la résilience du territoire et la pérennité de ses
valeurs paysagères et patrimoniales.
Atouts Faiblesses
o Un territoire riche d’une diversité de paysages, de vallées
et de plaines
o Un riche réseau hydrographique à l’origine de paysages
identitaires
o La reculée de Baume-les-Messieurs, reconnue comme site
remarquable et vecteur de tourisme
o Une diminution de la densité
bocagère du territoire
(remembrement)
o Un manque de protections
paysagères sur le bocage
o Des zones d’activités
insuffisamment intégrées dans
Mosaïque Environnement – 2025 P a g e | 8 ÉTAT INITIAL DE L’ENVIRONNEMENT – PCAET
o 108 bâtiments inscrits
o Un territoire abritant un patrimoine bâti varié et protégé à
l’aide de périmètres délimités des abords (PDA)
o De nombreux autres sites sont à l’étude pour la définition
de nouveaux PDA
o Deux site patrimoniaux remarquables (SPR)
le paysage ayant un impact
négatif sur l’image du territoire
o La banalisation des entrées de
village affecte l’attractivité du
territoire
2.1.1 Le paysage et le climat
Les conséquences du changement climatique sur les paysages peuvent être le risque d’assèche -
ment et d’incendie des boisements ainsi que le risque d’assèchement des cours d’eau, de leurs ripi-
sylves et des zones humides associées.
Afin de s’adapter aux évolutions climatiques prévues, il est possible de travailler sur les formes ur -
baines. Il est à renforcer par une intégration de la végétation dans les cœurs des bourgs notamment
(haies et alignements d’arbres, vergers urbains, etc.) et de mesures de protection à mettre en place
pour protéger les haies bocagères, marqueurs de l’identité du territoire.
Dans les projets de renouvellement urbain et de densification, les principes bioclimatiques peuvent
être intégrés pour faciliter l’intégration architecturale en s’appuyant sur la végétalisation des espaces
urbains, la valorisation de matériaux de construction traditionnels biosourcés, etc.
2.1.2 Enjeux et scénario au fil de l’eau
Enjeux Priorité État actuel Tendan ce Facteurs d’évolution
La préservation de la diversité et de la
qualité des identités et valeurs
paysagères, des caractères identitaires du
territoire, en articulation avec les besoins
de production d’ENR et face au
changement climatique
Pour le maintien de la structure et la diversité des
espaces naturels, agricoles, préservation des valeurs
panoramiques, prise en compte des effets de co-
visibilité, préservation du bâti
Pour tenir compte des évolutions possibles liées au
CC sur les espaces forestiers, les cours d’eau
Poursuite de la protection des sites et éléments
remarquables grâce aux nombreux outils législatifs
et réglementaires
Prise en compte croissante du petit patrimoine
Visibilité et place de plus en plus grande données
au patrimoine plus « ordinaire » et participant à
une meilleure valorisation des identités locales
L’augmentation de températures entraîne la
précocité des événements printaniers, le
déplacement des habitats terrestres des plantes et
des animaux et une adaptation de l’agriculture,
faisant évoluer les paysages du territoire
Risques de conflits entre le développement des
énergies renouvelables, la protection des vues et
paysages et le respect de l’identité architecturale
et naturelle du territoire
Dynamique de régression du bocage
Banalisation des paysages par une standardisation
du bâti dans les villages
Programmes & Stratégies en cours, contribuant à
répondre aux enjeux :
Elaboration du PLUi pour renforcer les mesures de
protection du patrimoine, et également du petit
patrimoine plus ordinaire (puits, chapelle, lavoirs
etc.)
La conciliation du patrimoine architectural
et du développement durable,
notamment la production d’ENR dans les
espaces bâtis et l’amélioration de la
performance énergétique des bâtiments
(rénovation, renouvellement urbain,
intégration de la végétalisation)
Pour concilier rénovation énergétique,
développement des énergies renouvelables,
végétalisation des espaces urbains avec la
préservation des qualités architecturale et
paysagères
Mosaïque Environnement – 2025 P a g e | 9 Enjeux paysagers et patrimoniaux
Légende
MN Des espaces urbains à adapter face au changement
climatique, en s'appuyant sur les formes
traditionnelles des villages et le bâti jurassien et bressan
= Des Cours d'eau structurant le paysage
à toutes les échelles : grandes structures karstiques,
cours d'eau de plaine et basses vallées,
sensibles aux sécheresses.
Un riche patrimoine bâti et naturel, à articuler
avec les besoins de transition et d'adaptation.
#77, Un espace agricole sur le plateau,
caractérisé par son bocage, qui souffre
d'une dynamique de réduction et d'une
fragilité face au changement climatique
... Unrelief constrasté, vecteur de trois grandes
entités (plaine, montagnes, plateau) et
d'une multitude de paysages, plus ou moins
sensibles face au changement climatique.
Source : OSCGE 2017 - DRAC - BD TOPAGE
Réalisation : 19/01/2026 -TL
Fond : © Contributeurs d'OpenStreetMap
N Echelle: 1:115 000
En | MOSAIQUE D © : 21" ENVIRONNEMENT valuation environementale du PCAET Conseil & Expertise É LL Espace Communautaire Lons Agglomération (39)
ÉTAT INITIAL DE L’ENVIRONNEMENT – PCAET
Carte 2 : Enjeux paysagers et patrimoniaux
Mosaïque Environnement – 2025 P a g e | 10 ÉTAT INITIAL DE L’ENVIRONNEMENT – PCAET
2.1.2.1.1 A retenir :
Les paysages du territoire de l’espace communautaire de Lons Agglomération se caractérisent par la
présence forte de cours d’eau à l’ouest, créant le paysage de plaine et structurant le territoire et sont
activité, mais également par la place de l’espace agricole et de son bocage sur les plateaux. Ces
deux éléments structurants du paysage sont toutefois sensibles : on constate une tendance au recul
du bocage, également support de biodiversité important et vecteur de résilience pour l’espace agri-
cole. Les cours d’eau sont quant à eux de plus en plus soumis à des sécheresses et étiages sévères,
engendrant non seulement une perte de biodiversité et un risque pour la ressource en eau, mais éga -
lement une dégradation d’un paysage identitaire.
ENJEUX : La préservation de la diversité et de la qualité des identités et valeurs paysagères, des ca-
ractères identitaires du territoire, en articulation avec les besoins de production d’ENR et face au
changement climatique
Préserver les paysages vallonnés du territoire, comme la reculée de Baume-les-Messieurs, est égale-
ment essentiel tant sur le plan écologique que culturel et touristique. Ces reliefs uniques sont vecteurs
d’une attractivité touristique, abritent une biodiversité remarquable avec des falaises calcaires, des
forêts préservées et des hydrosystèmes qui contribuent à l’équilibre du territoire. Ces reliefs naturels
participent à la régulation des températures locales, à la gestion des eaux pluviales et à la préserva-
tion de la biodiversité, trois éléments essentiels pour limiter les impacts du changement climatique. En
maintenant des espaces naturels en bon état, on renforce leur capacité à stocker du carbone et à
protéger les sols contre l’érosion et les sécheresses estivales. En conservant ces paysages, on protège
aussi un héritage géologique et historique précieux, tout en favorisant un développement durable
basé sur l’éco-tourisme et la mise en valeur des savoir-faire locaux. Leur préservation permet ainsi de
concilier protection de l’environnement et dynamisme économique, tout en garantissant aux géné-
rations futures la possibilité de profiter de ces panoramas.
Enfin, ECLA possède un patrimoine bâti remarquable et diversifié avec à la fois des édifices classés,
mais également de nombreux ouvrages de petit patrimoine qui renforcent l’identité du territoire, pré-
sent dans les bourgs. Dans le cadre de la transition énergétique, un équilibre devra être recherché
entre préservation de ce patrimoine bâti et les besoins de production d’énergie renouvelable ou de
rénovation.
ENJEUX : La conciliation du patrimoine architectural et du développement durable, notamment la
production d’ENR dans les espaces bâtis et l’amélioration de la performance énergétique des bâti-
ments (rénovation, renouvellement urbain, intégration de la végétalisation)
Mosaïque Environnement – 2025 P a g e | 11 ÉTAT INITIAL DE L’ENVIRONNEMENT – PCAET
3 Biodiversité et milieux naturels
3.1 En synthèse
ECLA est un territoire caractérisé par un paysage rural dominé par des forêts, des prairies et des
cultures agricoles avec un centre urbain diffus autour de Lons-le-Saunier, le centre-bourg et « capi -
tale » du département du Jura. Plusieurs zones urbaines sont parsemées au sein des communes.
Une faible dynamique d’enfrichement s’observe sur le territoire entre 2016 et 2022, avec peu de va-
riation dans l’occupation du sol :
-1,7% de milieux naturels ouverts
- 0,2% milieux de culture et -0,5% de milieux artificialisés
+2,2% de milieux naturels forestiers
Néanmoins, la majorité des milieux naturels ouverts, dont majoritairement des pelouses, ont disparu,
laissant place à des milieux cultivés ou forestiers. Ces pelouses se trouvaient parsemées sur la totalité
du territoire. Cependant, aujourd’hui la moitié du territoire d’ECLA est toujours constituée de milieux
ouverts. Au sein des pelouses sèches se trouvent plusieurs oiseaux particuliers. Ces milieux accueillent
quelques cavités et grottes sur l’ECLA, qui à leur tour, accueillent de nombreuses espèces de chiro-
ptères. Les milieux humides au sein de l’Espace Communautaire Lons Agglomération sont concen-
trées à l’Ouest du territoire, avec une forte présence de prairies humides. Les milieux boisés d’ECLA
sont répartis sur une majorité du territoire. Sur le territoire, la forêt recouvre 18% de sa surface, avec 6
454 ha, dont 44% (2 838ha) qui sont soumis au régime forestier, le Schéma Régional de Gestion Sylvi-
cole (SRGS)
Le territoire d’ECLA contient 4 sites Natura 2000, trois Zones Spéciales de Conservation (ZSC) sous la di -
rective « Habitats, faune, flore » (ZSC) et une Zone de Protection Spéciale (ZPS) sous la directive « Oi-
seaux » :
• Réseau de cavités à minioptères de Schreibers en Franche-Comté (6 cavités) - ZSC - FR4301351
• Reculées de la Haute Seille - ZSC - FR4301322 et ZPS - FR4312016
• Côte de Mancy - ZSC - FR4302001
Le territoire de ECLA comporte également 2 sites avec arrêtés préfectoraux de protection de Biotope
(APPB). Afin de préserver les habitats, l’arrêté dicte des mesures spécifiques qui s’appliquent au bio-
tope lui-même et non aux espèces. Il peut également interdire certaines activités ou pratiques pour
maintenir l’équilibre biologique du milieu. Les 2 APPB sont :
•Corniches calcaires du Jura – FR3800859
•Reculées de la Haute Seille – FR3800859
Atouts Faiblesses
o Une valorisation des milieux naturels identitaires
en cohérence avec leurs enjeux et les enjeux
économiques de l’attractivité touristique
o De nombreuses espèces patrimoniales et/ou
déterminantes et/ou protégées
o Présence de nombreux habitats riches favorables
à la faune
o Des continuités écologiques menacées
par le développement urbain et
l’imperméabilisation des sols
o Des sites fragiles aux activités humaines,
notamment les zones humides et les
milieux souterrains
o Des milieux sensibles au changement
Mosaïque Environnement – 2025 P a g e | 12 ÉTAT INITIAL DE L’ENVIRONNEMENT – PCAET
o Des milieux forestiers larges et riches en
biodiversité
o Des milieux souterrains remarquables, accueillant
des espèces de chiroptères
climatique
3.1.1 La biodiversité et le climat
Le changement climatique est la 3eme cause d’érosion de la biodiversité. Cette crise climatique est
en effet exceptionnelle car elle progresse extrêmement vite et parce qu’elle est due à l’une des es -
pèces qui la compose, l’Homme. Les activités humaines continuent en effet d’exercer des pressions
sur la biodiversité (changements d’usages des espaces terrestres, destruction et fragmentation des
habitats naturels, surexploitation des espèces animales et végétales, pollution, importations d’es-
pèces envahissantes et de maladies...).
Sur le territoire d’ECLA, il est difficile de déterminer dans quelle mesure le changement climatique a
participé au déclin de la biodiversité jusqu’ici. Toutefois, des signaux faibles sont déjà perceptibles tels
que les impacts ponctuels de certains évènements climatiques extrêmes.
Les zones humides seront également impactées par le manque d’eau et l’augmentation des tempé-
ratures, dégradant, voire détruisant, certaines de leurs fonctions écologiques. Au vu de l’état écolo -
gique déjà moyen des cours d’eau surfaciques du territoire, ECLA est particulièrement sensible à ce
phénomène. La préservation de la biodiversité est alors une solution majeure pour lutter contre le
changement climatique.
Ainsi, les territoires se tournent de plus en plus vers des solutions fondées sur la nature, c'est à dire des
aménagements utilisant des fonctions des espaces naturels, afin de contribuer à la végétalisation des
villes et à l’intégration de la biodiversité, même ordinaire, dans les projets. Différents leviers existent : la
désimperméabilisation, le choix des matériaux et la végétalisation. Par exemple, les espaces verts
peuvent être utilisés comme zones tampons face aux inondations, des arbres peuvent être plantés
pour constituer des îlots de fraîcheur afin de diminuer l'impact des canicules en ville…
Notons également le rôle incontestable des milieux et zones humides dans l’atténuation des effets du
changement climatique. Ces zones se comportent en éponges géantes qui absorbent et freinent la
circulation des eaux de crue, permettant de réduire l’intensité des crues et des inondations. Grâce à
leur végétation, les milieux humides permettent de protéger les rives et les rivages contre l’érosion.
Également, en stockant l’eau dans le sol ou en la retenant à leur surface, les milieux humides per-
mettent de soutenir les débits des cours d’eau, d’alimenter les nappes phréatiques et de contribuer
au rafraichissement de l’air en période estivale. Finalement, en tant que puits de carbone naturels,
les milieux humides atténuent le réchauffement climatique global, le carbone étant séquestré par la
végétation.
3.1.2 La biodiversité et la santé
La biodiversité est essentielle à la vie quotidienne, notamment en montagne. La santé dépend des
services écosystémiques tels que l’eau douce, la nourriture, et le bois, qui sont indispensables au bien-
être des populations. Les changements climatiques à long terme influencent la viabilité des écosys-
tèmes montagnards et modifient la répartition des plantes, des animaux, des agents pathogènes,
ainsi que des habitats humains.
Parmi les services écosystémiques liés à la biodiversité, l’accès aux espaces naturels contribue direc-
tement à la santé des habitants :
• Activité physique : les espaces naturels de montagne favorisent les activités de plein air comme
la randonnée, la pêche ou les promenades, participant ainsi à une bonne santé physique ;
Mosaïque Environnement – 2025 P a g e | 13 ÉTAT INITIAL DE L’ENVIRONNEMENT – PCAET
• Bien-être psychique : la proximité avec la nature est fortement liée à une meilleure santé mentale,
notamment par la réduction du stress et l’amélioration de la qualité de vie ;
• Réduction du bruit : la végétation aide à atténuer les bruits, renforçant la sensation de calme et
de dépaysement ;
• Confort thermique : les arbres et la couverture végétale jouent un rôle clé dans la régulation des
températures, atténuant les extrêmes thermiques, un enjeu en altitude face au changement cli-
matique.
3.1.3 Enjeux et fil de l’eau
Enjeux Priorité État actuel Tendance Facteurs d’évolution
La préservation des continuités écologiques
et de la biodiversité : maintien et
renforcement du réseau de zones humides ;
protection des espaces ouverts et des milieux
forestiers
Pour maintenir la structure et la diversité des espaces
agricoles, supports de biodiversité et permettant le
déplacement des espèces (taille des tènements, place des
prairies naturelles, diversité des cultures, place des
espaces boisés,…) et gérer les espaces forestiers de
manière adaptée pour maintenir leur multifonctionnalité
(rôle dans la préservation des sols, de l’eau, de la
biodiversité et des paysages, lutte contre les risques
naturels, stockage de carbone, source d’énergie
renouvelable…)
Loi Climat et Résilience et objectifs de Zéro
Artificialisation Nette
Politique de plus en plus volontariste de
prise en compte de la nature dans
l’aménagement et la gestion
Poursuite des dynamiques de prise en
compte et de protection des espaces
naturels et d’approfondissement de la
connaissance
Une trame agro-naturelle importante et un
réseau écologique riche
Changement des aires de répartition des
espèces, en lien avec le changement
climatique, mal connu et risque d’apparition
d’espèces exotiques envahissantes
Impact des sécheresses ponctuelles ou
répétées (assec de cours d’eau,
assèchement de ZH, dépérissement des
boisements, etc.)
Risque d’augmentation des incendies (feux
de forêts et feux de chaume) et destruction
d’habitats
Des risques de conflits d’usages entre
enjeux de développement des énergies
renouvelables et de biodiversité
Érosion progressive de la biodiversité liée à
la consommation de surfaces naturelles et
agricoles et à la fragmentation des milieux
Programmes & Stratégies en cours,
contribuant à répondre aux enjeux :
SCoT: définition de la TVB Stratégie Eau et
Biodiversité
La préservation de la nature ordinaire,
notamment dans l’espace urbain du cœur de
métropole, et assurer sa résilience face au
changement climatique (assec des cours
d’eau, assèchement des ZH, recul du bocage,
besoin de résorption des ruptures)
Pour leur valeur intrinsèque et les services qu’ils peuvent
rendre à l’homme. Préserver notamment les réservoirs de
biodiversité et les corridors écologiques, en prenant en
compte ces enjeux notamment dans la localisation des
possibles aménagements liés à la production d’énergies
renouvelables – développer la nature en ville
Mosaïque Environnement – 2025 P a g e | 14 Enjeux de biodiversité
|
Légende
Un réseau écologique à renforcer, pour préserver les espèces, habitats présents et assurer sa résilience face
aux conséquences du changement climatique
++ Corridors forestiers
++ Corridors de milieux ouverts
|__| Des milieux ouverts perméables, avec un bocage à préserver, facteur de richesse écologique et d'adaptation
— Des espaces forestiers sensibles et déjà impactés (déperissements, ravageurs, etc.)
— Un réseau humide fragile, surtout en contexte karstique, soumis à des étiages de plus en plus sévères.
TZ, Wilieux humides (CEN)
M La végétalisation des espaces urbains : un enjeu de cadre de vie et d'adaptation
Source : OSCGE 2017 - BD TOPAGE - SCoT Pays Lédonien - CEN
Fond : © Contributeurs d'OpenStreetMap
Réalisation : 03/04/2025 - ED
Echelle: ]:115 000
MOSAÏQUE N EE |
0 1 2km CZ ENVIRONNEMENT Évaluation environementale du PCAET CZ Conseil & Expertise Espace Communautaire Lons Agglomération (39)
ÉTAT INITIAL DE L’ENVIRONNEMENT – PCAET
Carte 3 : Enjeux de biodiversité
Mosaïque Environnement – 2025 P a g e | 15 ÉTAT INITIAL DE L’ENVIRONNEMENT – PCAET
3.1.3.1.1 A retenir :
Le territoire est parcouru de cours d’eau à l’ouest offrant une diversité d’habitats de plaine et de mi-
lieux aquatiques, et un réseau de zones humides dense le long des vallées. Ces espaces, riches en
biodiversité et constituant une trame bleue importante, sont toutefois sensibles face au changement
climatique et aux sécheresses répétées et intenses, fragilisant les milieux humides et aquatiques. L’en -
semble des cours d’eau est concerné, les plus petits par un assec prolongé et les plus grands par des
étiages forts et un assèchement des zones humides les accompagnant.
L’espace forestier est également soumis à des pressions d’origine climatique ; les sécheresses et
l’augmentation des températures accentuant le risque de dépérissements, de ravageur et risque
d’incendie (particulièrement présent sur le secteur du Jura, en raison de boisements résineux denses).
Les milieux naturels sont également fragilisés par de nombreuses pressions anthropiques qu’ils su-
bissent : urbanisation, pollutions diverses, prélèvements importants en eau, intensification agricole...
Les dérèglements climatiques s’ajoutent à cette liste et renforceront les dégradations des écosys-
tèmes remarquables :
• Fragilisation / Risques de disparition de certains milieux ;
• Adaptation ou disparition de certaines espèces animales et végétales ;
• Prolifération d’espèces envahissantes ;
• Migrations des espèces.
Les zones humides, en particulier les vallées alluviales et les milieux associés, sont plutôt sensibles à
l’assèchement et la concentration des polluants liées à la baisse du volume d’eau disponible. Les ser-
vices écosystémiques proposés par ces milieux se trouveront déséquilibrés : libération de gaz carbo-
nique et de méthane, régulation des crues, assainissement naturel des eaux de surface.... Les stress
hydrique et thermique impactent particulièrement les écosystèmes forestiers par la prolifération des
risques phytosanitaires et physiques. La sécheresse augmente également le risque de feu de forêts,
qui est non négligeable à l’échelle du département du Jura et du territoire d’ECLA
ENJEUX : La préservation de la nature ordinaire, notamment dans l’espace urbain du cœur de métro-
pole, et assurer sa résilience face au changement climatique (assec des cours d’eau, assèchement
des ZH, recul du bocage, besoin de résorption des ruptures)
Les grandes continuités écologiques identifiées (haies bocagères notamment) sont donc fragilisées
par le changement climatique, en plus des ruptures de continuité et de la fermeture des milieux ou-
verts par l’enfrichement. Le renforcement de la perméabilité (en particulier dans l’espace agricole)
et des continuités est un enjeu pour l’adaptation des milieux naturels face au changement clima-
tique, en facilitant le déplacement des espèces, en offrant des milieux plus riches et variés et donc
plus résilients.
ENJEUX : La préservation des continuités écologiques et de la biodiversité : maintien et renforcement
du réseau de zones humides ; protection des espaces ouverts et des milieux forestiers et de leurs
continuités. Lutte contre la déprise agricole et la fermeture des milieux ouverts qui constituent un im-
portant réseau de corridor à l’échelle du territoire.
Mosaïque Environnement – 2025 P a g e | 16 ÉTAT INITIAL DE L’ENVIRONNEMENT – PCAET
4 La ressource en eau et les milieux aquatiques
4.1 En synthèse
Le territoire d’ECLA recoupe 3 bassins versants :
• Celui de la Seille est grandement majoritaire en superficie (98%) et abrite toutes les masses d’eau
superficielles présentes sur le territoire ;
• Ceux de la Loue et de la Haute Vallée de l’Ain que l’on retrouve en bordures Nord-Est et Sud-Est du
territoire, mais ne couvrent aucun linéaire d’eau courante, seul la ligne de répartition des eaux de
ces bassins versants est présente.
Il est traversé par 2 cours d’eau principaux : la Vallière qui s’écoule d’Est en Ouest, de Revigny (400
m) à Condamine, sur une distance d’environ 17 km, et ses affluents principaux le Solvan et le ruisseau
du Château. La Sorne, qui s’écoule d’Est en Ouest, de Vernantois à Courlaoux où elle rejoint la Val -
lière, sur une distance d’environ 14 km, et son affluent principal le Savignard.
Le réseau hydrographique de surface, constitué d’un chevelu de ruisseaux de gabarit variable, est
majoritairement concentré sur les deux tiers Ouest, là où la topographie est plus permissive pour la for-
mation de cours d’eau. Pour autant, la partie Est du territoire abrite un milieu aquifère souterrain non
négligeable et une multitude de ruisseaux.
L’état écologique des cours d’eau qui traversent le territoire est globalement médiocre, à l’exception
de la Sorne (état moyen) et du ruisseau de la Madeleine (état bon). Tous les cours d’eau subissent
des pressions, parmi lesquelles :
• Les altérations du régime hydrologique et de la continuité écologique (ex : prélèvements d’eau, re-
tenues, seuils...), de la morphologie (rectifications, curages, endiguements…) et de la diversité phy-
sique des milieux (habitats, régimes d’écoulement…).
• Les altérations de la qualité physico-chimique, avec la pollution aux nitrates ou aux matières orga-
niques agricoles et des zones urbaines. L’ensemble du territoire de l’ECLA est sensible à l’eutrophisa-
tion lié aux pollutions diffuses et aux rejets directs ou indirects de nitrates. La pollution par les pesti-
cides est la pression principale qui affecte tous les cours d’eau, avec le plus grand risque d’impact
fort, susceptible de déclasser la note de qualité des masses d’eau.
Cependant, tous les cours d’eau sont encore jugés en bon état chimique depuis l’état des lieux du
SDAGE réalisé en 2019. La pression exercée par la pollution aux pesticides risque d’entrainer une dé -
gradation de cette qualité si aucune gestion n’est entreprise.
Les eaux souterraines présentent trois typologies différentes :
• Des nappes alluviales associées aux cours d’eau (Alluvions de la Bresse – Plaine de la Vallière)
• Des nappes sédimentaire issues de la dégradation des roches (Miocène de Bresse et le Domaine
marneux de la Bresse et du Val de Saône)
• Et des nappes karstiques issues de la fragmentation des roches calcaires (Domaine triasique et lia -
sique du Vignoble Jurassien, Calcaires jurassiques, chaîne du 1er plateau ainsi que les calcaires et
marnes jurassiques, chaîne du Jura et Bugey (Bassin Versant Ain et Rhône))
Ces nappes ont une forte sensibilité aux pollutions diffuse. Le karst est particulièrement sensible aux
pollutions de surface de par sa très forte perméabilité et l’infiltration rapide des eaux. Les nappes allu -
viales sont particulièrement sensibles aux pollutions des cours d’eau car elles sont interconnectées au
lit mineur.
Mosaïque Environnement – 2025 P a g e | 17 ÉTAT INITIAL DE L’ENVIRONNEMENT – PCAET
La production et la distribution de l’eau potable est assurée par la Régie Eau ECLA et 3 syndicats des
eaux :
• Régie Eau ECLA : Trenal, Condamine, Courlaoux, Courlans, Montmorot, St-Didier, Messia-sur-Sorne,
Bourbouzon, Macornay, Moiron, Montaigu, Lons-le-Saunier, l’Etoile, Frébuans, Chilly-le-Vignoble,
Conliège
• Syndicat Mixte Eau et Assainissement Beaufort : Gevingey, Cesancey
• Syndicat Intercommunal des Eaux de la Haute Seille : Le Pin, Villeneuve-sous- Pymont, Chille,
Baume-les-Messieurs
• Syndicat Intercommunal des Eaux de Heute la Roche (gérer par Suez) : Pannessières, Perrigny,
Briod, Vevy, Verges, Publy, Revigny, Vernantois, Bornay, Geruge
L’alimentation en eau potable est protégée par un plan de gestion de la sécurité sanitaire des Eaux
(PGSSE) et différents périmètres de protection autours des captages d’eau potable.
Enfin, l’assainissement collectif et non-collectif est géré par l’Espace Communautaire de Lons Agglo-
mération sur tout le territoire. 13 Stations d’épuration sont présentes pour la gestion des eaux usées,
mais leur capacité de traitement est insuffisante pour le territoire (55 000 Equivalents habitant de ca-
pacité pour 70 500 équivalents habitant de charge polluante). De nombreuses stations sont non-
conformes, et induisent des rejets d’eau polluées dans les milieux naturels.
Atouts Faiblesses
o Des masses d’eau superficielles présentant un bon état
chimique
o La régie ainsi que les 3 syndicats en charge de la
protection, de la production et de la distribution de
l’eau potable
o Des captages en eau potable qui font l’objet d’un
périmètre de protection
o Des réseaux de distribution performants.
o Des masses d’eau souterraines en bon état écologique
o Une bonne qualité de l’eau potable sur le territoire
o Elaboration en cours d’un schéma directeur d’eau
potable sur l’ECLA
o Des masses d’eau superficielles
présentant globalement un état
écologique dégradé.
o Absence de SAGE sur le territoire
o Des masses d’eau souterraines
sensibles aux pollutions de part
leur caractère karstique
o Une ressource en eau sensible
aux conditions climatiques et
déjà soumise à des problèmes
d’étiage en période estivale
o Des captages prioritaires pour la
pollution aux pesticides et aux
nitrates
o Des capacités d’assainissement
déjà dépassées et de
nombreuses STEP non-conformes
4.1.1 La ressource en eau et le climat
Le changement climatique impactera l’approvisionnement en eau potable. La ressource est en effet
principalement souterraine, donc davantage sensible au changement de répartition de la pluviomé -
trie, et sa capacité de stockage est limitée. En lien avec l’augmentation démographique et les be -
soins agricoles, les besoins en eau se feront alors sentir tandis que la ressource tend à diminuer, ce qui
sera susceptible de faire apparaitre des conflits d’usage. Un déficit quantitatif lié aux prélèvements
sur la masse d’eau Alluvions de la Bresse - Plaine de la Vallière a déjà été identifié par le profil environ-
Mosaïque Environnement – 2025 P a g e | 18 ÉTAT INITIAL DE L’ENVIRONNEMENT – PCAET
nemental régional. L’enjeu est donc de veiller à la bonne adéquation entre la demande et la res-
source sur l’ensemble des différents secteurs. De plus, le diagnostic associé à l’élaboration du PLUi-H
identifie déjà un lien entre la tension autour de la ressource en eau et la fréquentation touristique en
été. Cet enjeu est vital pour permettre au territoire de concilier approvisionnement en eau potable
dans un contexte de dérèglement climatique, et développement économique et touristique.
Parmi les sources exploitées, le SDAGE Rhône Méditerranée 2022-2027 identifie 2 masses d’eau souter-
raines à fort enjeu pour la satisfaction sécurisée et pérenne des besoins en eau potable, appelées «
zones de sauvegarde » (Alluvions de le Bresse » et « Alluvions de la Vallière »). Le SCoT du Pays Lédo-
nien indique que les communes de Baumes-les-Messieurs et Pannessières sont en déficit d’alimenta -
tion en eau potable.
Le changement climatique est également un facteur aggravant sur l’assainissement et la qualité des
eaux car il favorise la prolifération des bactéries et l’eutrophisation (chaleur) ou une moindre dilution
des pollutions (moins d’eau). La situation est aujourd’hui déjà tendue sur le territoire. La somme des
capacités nominales de traitement sur l’ensemble des stations du territoire est de 55 045 équivalents
habitants et la charge maximale en entrée est de 70 513 EH, soit un dépassement de 15 468 EH en
2023. Certaines stations sont par ailleurs considérées non conformes.
Sur le réseau hydrographique, l’impact du changement climatique sera visible à travers des situations
d’assecs plus régulières (50% des cours d’eau en 2022), créant des ruptures de la trame bleue, un
moindre remplissage en aval, aggravé par un assèchement des zones humides (perte du soutien
d’étiage en période estivale). Par ailleurs, les milieux soumis à de fortes pressions anthropiques (mor-
phologie, pollutions, etc.) sont rendus aujourd’hui plus sensibles et moins résilients.
4.1.2 Ressource en eau et santé
La pollution de l’eau peut être de plusieurs types : physique (limpidité altérée, température modifiée),
chimique (nitrates, métaux et autres micropolluants), organique (entraînant une surconsommation
d’oxygène indispensable à la vie aquatique) ou microbiologique, avec l’introduction de germes pa-
thogènes (bactéries, virus, parasites).
Les risques pour la santé humaine peuvent être microbiens et se manifester à court terme par des pa -
thologies, le plus souvent de nature digestive. Ces pathologies font généralement suite à des conta -
minations accidentelles ou à des pannes dans la procédure de désinfection de l’eau.
Bien que ces situations soient rares, une contamination importante par des agents chimiques (mé-
taux, pesticides, nitrates …) peut survenir lors de déversements accidentels. Dans ce cas, les risques
sanitaires sont immédiats.
4.1.3 Enjeux et fil de l’eau
Enjeux Priorité État actuel Tendance Facteurs d’évolution
La préservation et la restauration des milieux
aquatiques et humides (qualité, quantité) :
état écologique dégradé des masses d’eau
superficielles
Pour la préservation de toute atteinte, qu’elle soit directe
(imperméabilisation) ou indirecte (perturbation de
l’hydrologie de cours d’eau alimentant les zones humides,
préservation des cours d’eau, zones humides et milieux
favorables au stockage de l’eau, à son épuration). Une
attention particulière à porter à la localisation
Évolutions importantes de la gouvernance
de l’eau avec la GEMAPI
Amélioration de la connaissance sur le
fonctionnement et les ressources
Poursuite des dynamiques de protection et
gestion durable de la ressource en eau pour
la sécurisation de l’approvisionnement ne
eau potable
Mosaïque Environnement – 2025 P a g e | 19 ÉTAT INITIAL DE L’ENVIRONNEMENT – PCAET
d’éventuels aménagements liés aux énergies
renouvelables et aux pollutions liées aux ruissellements
Pour améliorer la qualité écologique des cours d’eau
Affaiblissement des règlementations sur
l’utilisation des phytosanitaires
Augmentation des phénomènes de
sécheresse (durée et fréquence)
Dégradation de la qualité des masses d’eau
Augmentation des besoins dans un
contexte de raréfaction de la ressource du
fait du CC
Baisse de la ressource en eau et sensibilité
accrue aux pollutions des nappes karstiques
utilisées pour l’AEP avec des risques
d’impacts sur la santé
(concentration/développement de
bactéries, concentration des polluants …)
Risques de conflit d’usages entre enjeux de
développement des énergies renouvelables
et de ressource en eau : aménagements liés
aux énergies renouvelables pouvant
dégrader les régimes hydrauliques de cours
d’eau
Une consommation en eau potable qui va
poursuivre son augmentation en lien avec la
pression touristique
Programmes & Stratégies en cours,
contribuant à répondre aux enjeux :
SCoT : réflexion sur les objectifs démographiques
à articuler avec la ressource en eau et état des
lieux des pressions sur les masses d’eau
souterraines
PGSSE en cours ; plan de gestion de la sécurité
sanitaire des eaux
Périmètre de protection de captage
2 captages prioritaires identifiés dans le SDAGE
RMC
La prise en compte du cycle de l’eau dans le
développement urbain, notamment en lien
avec les besoins de gestion des eaux pluviales
et l’articulation avec la densification.
(Gestion des eaux usées, gestion alternative des eaux
pluviales, limitation de l’imperméabilisation) pour
anticiper les effets du changement climatique
La protection de la ressource en eau et la
sécurisation des usages de l’eau (qualité,
quantité) pour réduire la vulnérabilité du
territoire au changement climatique, en
tenant compte de la pression du tourisme en
période estivale.
En contribuant à réduire les consommations, en
protégeant la ressource pour garantir la santé des
habitants et en anticipant les effets potentiels
d’aménagements liés aux énergies renouvelables sur la
qualité de l’eau.
Pour tenir compte du contexte karstique et des enjeux de
sécurisation de l’alimentation en eau potable, sur le plan
qualitatif et quantitatif
Mosaïque Environnement – 2025 P a g e | 20 Enjeux sur la ressource en eau
Légende
Un contexte kasrtique, qui fragilise la ressource,
avec une sensibilité accrue aux pollutions
et au changement climatique
_—— Une ressource superficielle dans un état écologique
médiocre, avec des pressions et pollutions, sensible
face au chanement climatique (étiages,
faible dillution des rejets, etc.)
La conformité et la capacité des stations d'épuration,
un enjeu pour la préservation de la ressource en eau
(karst, étiages, orages, etc.)
+ Non conforme {2022)
+ Conforme (2022)
_ Ure nécessaire baisse des consommations
en eau dans les usages
Des interconnexions à rechercher pour sécuriser
l'approvisionnement en eau potable
Une ressource en eau sous pression, avec un risque
de rupture d'approvisionnement aggravé par
le changement climatique
"1 Aire d'alimentation de captage
C2 Zones de sauvegarde
Zone vulnérable aux nitrates
EM Communes en déficit sur l'AEP
Fond : © Contributeurs d'OpenStreetMap
Source : OSCGE 2017 - BD TOPAGE - SCoT Pays Lédonien - SISPEA
Réalisation : 03/04/2025 - ED
Echelle: ]:115 000
N |
0 ] 2 km
Évaluation environementale du PCAET
Espace Communautaire Lons Agglomération (39)
MOSAÏQUE
ENVIRONNEMENT
/ Conseil & Expertise
ÉTAT INITIAL DE L’ENVIRONNEMENT – PCAET
Carte 4 : Enjeux de la ressource en eau
Mosaïque Environnement – 2025 P a g e | 21 ÉTAT INITIAL DE L’ENVIRONNEMENT – PCAET
4.1.3.1.1 A retenir
Le territoire d’ECLA est traversé par deux cours d’eau principaux — la Vallière et la Sorne — ainsi
qu’un maillage de ruisseaux et zones humides, essentiellement localisés sur le tiers ouest. Leur bon
état chimique est pour l’instant globalement maintenu, mais l’état écologique des masses d’eau su-
perficielles est dégradé dans la majorité des cas, sous l’effet combiné des pollutions diffuses agricoles
(nitrates, pesticides), des rejets d’eaux usées insuffisamment traitées, et de l’altération des régimes
hydrologiques (rectifications, seuils, curages, etc.). Ces pressions rendent les cours d’eau moins rési-
lients face aux effets du changement climatique
ENJEUX : L’approvisionnement en eau du territoire d’ECLA dépend assez entièrement de ressources
souterraines, dont certaines sont déjà perturbées par le changement climatique et les pompages. Un
de risque de rupture d’approvisionnement en eau potable est probable dans les prochaines années,
le territoire y est vulnérable. La préservation des ressources par la réduction des consommations et la
sécurisation de l’approvisionnement par le renforcement des réseaux permet de limiter les risques sur
l’alimentation en eau potable. Dans une situation où certaines communes sont déjà en tension
(Baume-les-Messieurs notamment), une gestion économe de la ressource est nécessaire.
ENJEUX : La protection de la ressource en eau et la sécurisation des usages de l’eau (qualité, quanti-
té) pour réduire la vulnérabilité du territoire au changement climatique, en tenant compte de la pres-
sion du tourisme en période estivale et du contexte karstique.
Il existe également un risque de dégradation accrue des de la qualité des eaux superficielles, dans
un contexte où la diminution des volumes et la hausse des températures favorise l’eutrophisation,
l’apparition de bactéries et la concentration des pollutions (pesticides, nitrates, rejets d’épuration des
STEP non-conforme etc.). Le territoire est en plus soumis à un déficit sur l’assainissement, avec des ca -
pacités déjà largement dépassées et des stations non-conformes, en particulier en performance, qui
induisent des rejets d’eau pollués dans les milieux naturels.
ENJEUX : La préservation et la restauration des milieux aquatiques et humides (qualité, quantité) : état
écologique dégradé des masses d’eau superficielles
Enfin, des risques de conflits d’usage peuvent apparaître, entre les besoins domestiques, industriels
(agro-alimentaire notamment) et agricoles, lors des situations de sécheresses fortes. Une baisse de la
demande est donc nécessaire, pour permettre, à une plus grande échelle, de répondre à l’en-
semble des besoins, dans un contexte de forte croissance démographique.
ENJEUX : La prise en compte du cycle de l’eau dans le développement urbain, notamment en lien
avec les besoins de gestion des eaux pluviales et l’articulation avec la densification.
Mosaïque Environnement – 2025 P a g e | 22 ÉTAT INITIAL DE L’ENVIRONNEMENT – PCAET
5 Risques naturels et technologiques
5.1 En synthèse
Le territoire d’ECLA est sujet à une multitude de risques naturels et technologiques, dominés par le
risque de glissements de terrain. Les impacts liés aux glissements de terrain sont amenés à s’amplifier
au regard du changement climatique et de l’augmentation en fréquence et intensité des séche-
resses. L'adaptation au changement climatique passera donc par une politique d'amélioration du
bâti.
Les autres risques naturels présents sur le territoire sont :
•Le retrait-gonflement des argiles : La majorité du territoire est concerné par un risque de retrait gon-
flement moyen, sauf 5 communes non concernées.
•L’aléa sismique : L’aléa du territoire est modéré, toutes les communes sont classées en sismicité mo-
dérée, catégorie 3. Cette catégorie impose certaines règles de constructions.
•Le risque Radon : Sur l’Espace Communautaire de Lons Agglomération, toutes les communes sont
catégorisées Potentiel Catégorie 1 (potentiel radon faible).
•Le risque feu de forêt : Le risque feu de forêt est très présent sur le territoire. Les communes de
Baume-les-Messieurs et de Macornay sont exposées au risque à un niveau majeur. Les seules com-
munes n’étant pas à risque d’incendies de forêts sont Courlaoux, Courlans, Condamine, Frébuans et
Trenal. Les communes au nord d’ECLA sont identifiées comme à risque modéré et le sud et sud-est de
la collectivité sont désignés à risque élevés.
•Le risque inondation : Une bonne partie des communes de la plaine et de la basse vallée à l’Ouest
du territoire sont soumises au risque inondations. De nombreuses zones urbanisées sont également en
zone inondations. Ces espaces sont gérés par des Plan de Prévention des Risques d’inondation (PPRi)
(PPRi La Vallière, PPRi Seille, PPRI Sorne-Savignard)
•Le risque d’inondation par remontées de nappes : fort enjeu sur le territoire, particulièrement dans le
contexte actuel du changement climatique et son impact sur les évènements pluviaux (fréquence et
impact potentiellement accrus).
L’enjeu pour limiter l’impact des inondations est de préserver les espaces de bon fonctionnement des
cours d’eau participant à la circulation des eaux de crue et la réduction de l’intensité des crues et
des inondations. Ce risque naturel soulève également l’enjeu de restauration morphologiques des
cours d’eau pour éviter la concentration des eaux de ruissellement, pour contribuer au débordement
des eaux en plaine et ainsi limiter le risque d’inondation.
Il existe également certains risques technologiques :
Risque industriel : L’ECLA compte actuellement 33 ICPE, dont une à l'arrêt et une ICPE classée SEVESO
seuil bas : PERRENOT JT LOGISTIC à Courlaoux
Le risque minier : Au sein de la collectivité, les communes à risques d’aléas miniers sont Montaigu et
Montmorot, Perrigny et Lons-le-Saunier. Le risque minier peut avoir des conséquences principalement
sur le bâti.
Risques de transports de matières dangereuses : Le territoire est traversé par les canalisations de GRT-
gaz, le pipeline Sud européen (SPSE) ainsi que le saumoduc Etrez- Poligny :
• l’Alimentation Montmorot DP Lons-le-Saunier pour le gaz naturel traverse les communes de l’Etoile,
de Montmorot et de Saint-Didier.
Mosaïque Environnement – 2025 P a g e | 23 ÉTAT INITIAL DE L’ENVIRONNEMENT – PCAET
• le pipeline Sud européen (SPSE) pour les hydrocarbures traverse les communes de Chilly-le-Vi-
gnoble, Courlans, Montmorot, Frébuans, Trenal, Saint-Didier et Cesancey.
Le territoire est aussi concerné par le risque TDM par route. Il comporte plusieurs routes à fort trafic qui
sont empruntées pour le transport de matières dangereuses.
Atouts Faiblesses
o Un territoire couvert par des documents de
prévention et de gestion des risques
d’inondations et glissement de terrain (PPRi,
PPR mouvement de terrain)
o Un risque d’inondations bien connu et
identifié
o Risque faible de radon sur la majorité du
territoire
o Pas de PPRT (pas d’ICPE classés SEVESO AS/
seuil haut)
o Travaux de dépollution engagés depuis
1986
o Pas de territoire à risque important
d’inondation
o Un territoire concerné par une multitude de
risques à la fois naturel et technologique
o Un territoire principalement concerné par
le risque de glissement de terrain
o Des risques technologiques existants, liés à
l’activité industrielle (installations classées)
o 1 installation classées SEVESO
o 33 ICPE
o Un territoire concerné par les feux de forêts
et les mouvements de terrain, avec un
risque d’intensification lié au changement
climatique
o Une concentration des risques autour de
Lons-le-Saunier
5.1.1 Les risques majeurs et le climat
Le risque naturel le plus important sur le territoire est le risque de glissement de terrain. 14 communes
sont couvertes par un plan de prévention des risques de mouvements de terrain (PPR MVT) et 102
mouvements de terrains ont été recensés sur le territoire par le BRGM. Le changement climatique, en
intensifiant les ruissellements, les pluies et en augmentant les épisodes de sécheresses, devrait aug-
menter la probabilité d’occurrence de ce phénomène. Le risque de glissement doit donc faire l’objet
d’une vigilance particulière.
De plus, avec les fortes chaleurs, le froid, les inondations ou les vents forts, le changement climatique
induit une multiplication des risques pour les sites industriels. Une installation industrielle peut par
exemple être impactée par une catastrophe naturelle, provoquant un accident dont les consé -
quences peuvent porter atteinte, à l’extérieur de l’emprise du site industriel, aux personnes, aux biens
ou à l’environnement. Ces risques naturels peuvent donc à leur tour générer des risques technolo -
giques.
Sur ECLA, on note une aggravation probable du risque d’inondation, particulièrement pour le risque
d’inondation par ruissellement, du fait de l’intensification des précipitations. L’incertitude est forte
quant à l’évolution des tempêtes.
Les projections indiquent une aggravation du risque de feu de forêt liée à l’augmentation des condi -
tions météorologiques favorables aux incendies (absence de pluie, chaleur) et de la sensibilité des
milieux (assèchement, mortalité) : allongement de la période des feux, extension des zones à risque...
ce qui pourrait avoir un impact très fort sur le territoire à l’avenir.
Mosaïque Environnement – 2025 P a g e | 24 ÉTAT INITIAL DE L’ENVIRONNEMENT – PCAET
5.1.2 Risques majeurs et santé
Les risques naturels majeurs en moyenne montagne, tels que les glissements de terrain, inondations et
mouvements de terrain, peuvent avoir des impacts directs et indirects sur la santé des populations.
Par exemple :
- L’immersion partielle ou prolongée lors d’inondations en vallée peut entraîner hypothermie,
notamment en raison des températures plus basses en montagne ;
- Le contact avec des eaux polluées par des résidus agricoles, micro-organismes ou produits
chimiques peut provoquer infections et allergies, particulièrement en cas de blessures ou fra -
gilité cutanée ;
- Les sources d’eau potable, souvent issues de captages ou puits privés en zone rurale, peuvent
être contaminées lors de phénomènes tels que glissements de terrain ou crues intenses, me-
naçant la qualité sanitaire de l’eau ;
- Le risque épidémiologique post-crue peut dégrader les conditions d’hygiène et d’insalubrité
dans les bâtiments, tandis que la coupure des réseaux (électricité, eau potable, chauffage)
complique la gestion de crise dans des zones parfois isolées.
Les risques technologiques liés à l’activité humaine peuvent aussi provoquer des rejets dans l’environ-
nement (air, eau, sol) avec des effets aigus et chroniques sur la santé. Dans l’agglomération de Lons
le Saunier, la circulation des substances dangereuses sur les axes routiers constitue une source de vigi-
lance.
De plus, la topographie et l’éloignement de certaines communes augmentent la vulnérabilité face
aux défaillances des réseaux et isolent temporairement les populations, compliquant l’intervention
des secours et le maintien des services essentiels.
5.1.3 Enjeux et fil de l’eau
Enjeux Priorité État actuel Tendance Facteurs d’évolution
Limiter l’apparition de risques encore peu
présents, se développant grâce au
changement climatique : feux de forêt, retrait
gonflement des argiles, sécheresses
Prise en compte croissante de la
vulnérabilité des systèmes naturels et
humains aux aléas climatiques
(existence de PPR, PPRM etc.)
Poursuite de l’amélioration de la
connaissance des aléas naturels et de la
protection via les outils réglementaires
de protection (PPR)
La prise de compétence GEMAPI
pouvant renforcer la gestion concertée
et cohérente
Tendance à l’augmentation des risques
liés aux phénomènes météorologiques
induits par le changement climatique :
RGA, inondations, tempêtes, feux de
forêt, etc.
Programmes & Stratégies en cours,
contribuant à répondre aux enjeux :
PLUi & SCoT : désimperméabilisation
La réduction de la vulnérabilité du territoire
face à l’amplification des risques naturels par
le changement climatique : protéger la
population et les biens contre les risques liés
au inondations, ruissellements, glissements
de terrain, tempêtes.
L’intégration du risque comme composante
de l’aménagement avec la prise en compte
des PPRt, PPRi, PPRM et canalisations de
transport de matières dangereuses dans la
localisation des aménagements potentiels liés
aux énergies renouvelables
Mosaïque Environnement – 2025 P a g e | 25 Enjeux de prévention et gestion des risques
Légende
Avr Secteur principal à enjeu de remontée de nappe, à un risque accru de mouvements de terrain liés
— Un risque d'inondation très présent, le long su CONIENE topographique #1 GRHIOGIQUE,
des cours d'eau, mais également en raison rs pareurer ce pement AGO ES ere du contexte karstique et d'un risque événements météo violents, et un risque
de remontée de nappe à l'Ouest de retrait-gonfiement des argiles l
7 Zone karstique, à enjeu d'inondation en RS TES (débordement du réseau souterrain, le changement climatique et les déperissements
réactivité de la nappe] TR Des espaces urbains sensibles au risque de ruissellement
111 Un relief contrastées, de pentes, contribuant et exposés û des aléas multiples, facteurs d'exposition
aux risques de mouvements de terrain des BOBUIIONS : à et au ruissellement #% Un risque industriel présent et concentré autour
de Lons le Saunier, avec un enjeu de protection
de la population et exposé lui-même aux aléas naturels
Source : OSCGE 2017 - BD TOPAGE - Pays Lédonien - DREAL
Fond : © Contributeurs d'OpenStreetMap
Réalisation : 03/04/2025 - ED
Echelle: ]:115 000
MOSAÏQUE
À C 0 1 2km ENVIRONNEMENT Æ Évaluation environementale du PCAET Conseil & Expertise Espace Communautaire Lons Agglomération (39)
ÉTAT INITIAL DE L’ENVIRONNEMENT – PCAET
Carte 5 : Enjeux et gestion des risques
Mosaïque Environnement – 2025 P a g e | 26 ÉTAT INITIAL DE L’ENVIRONNEMENT – PCAET
5.1.3.1.1 A retenir
Le territoire de ECLA est soumis principalement au risque de glissement de terrain sur une partie im-
portante de son territoire (14 communes sont couvertes par un plan de gestion des risques mouve -
ment de terrain), en raison du contexte topographique. Cependant ce risque est bien identifié et en-
cadré au travers des documents de gestion. Le risque inondation, ainsi que le risque de feu de forêt
sont également des enjeux importants pour la sécurité du territoire. Pour l’avenir, l’enjeu est désormais
d’intégrer les conséquences du changement climatique dans la prévention de ces risques : des phé-
nomènes qui seront moins lents, moins prévisibles et avec une occurrence plus soutenue en raison
des événements météorologiques violents (sécheresse, pluie intense, gel-dégel fréquent etc.), et
pouvant également être plus intenses et plus difficiles à maitriser. Ces risques peuvent également être
aggravés par l’artificialisation des sols, dans les espaces urbains et notamment engendrer un ruisselle -
ment important des eaux pluviales, y compris dans les plus petits bourgs. La présence de végétation
en ville est alors un levier de lutte contre ce risque, tout comme la préservation des espaces de bon
fonctionnement des cours d’eau sur l’ensemble du territoire.
ENJEUX : La réduction de la vulnérabilité du territoire face à l’amplification des risques naturels par le
changement climatique : protéger la population et les biens contre les risques liés au inondations, ruis-
sellements, glissements de terrain, tempêtes.
Concernant le risque incendie, le changement climatique a un impact particulièrement négatif, les
espaces boisés sont plus fragiles, et le risque d’incendie commence à prendre place sur le territoire
(en particulier sur les espaces de résineux). Les pratiques sylvicoles doivent être adaptées et les me -
sures de défense incendie préparées à ce nouveau risque.
ENJEUX : Limiter l’apparition de risques encore peu présents, se développant grâce au changement
climatique : feux de forêt, retrait gonflement des argiles, sécheresses
Enfin, les risques technologiques, bien que résiduels sur le territoire, sont à prendre en compte. Parmi
les risques potentiellement dangereux pour le futur du territoire, on peut noter la présence d’un site in-
dustriel SEVESO (seuil bas), ainsi que la présence de différentes canalisations de transport d’hydrocar-
bure (canalisations de GRTgaz pour le gaz naturel, pipeline Sud Européen, et le saumoduc Etrez-Poli-
gny).
ENJEUX : L’intégration du risque comme composante de l’aménagement avec la prise en compte
des PPRt, PPRi, PPRM et canalisations de transport de matières dangereuses dans la localisation des
aménagements potentiels liés aux énergies renouvelables
Mosaïque Environnement – 2025 P a g e | 27 ÉTAT INITIAL DE L’ENVIRONNEMENT – PCAET
6 Nuisance et pollutions
6.1 En synthèse
La nuisance liée au bruit constitue une des nuisances majeures ressenties par la population. Le terri-
toire d’ECLA compte plusieurs infrastructures routières faisant l’objet d’un classement sonore. Impac -
tant une part non négligeable de la population de l’espace communautaire, ces infrastructures sou-
lèvent l’enjeu du changement des modes de déplacement, tant pour la réduction des nuisances so -
nores que l’amélioration de la qualité de l’air. Les principaux axes routiers sont concernés par des
plans de prévention du bruit dans l’environnement (PPBE). Cette démarche à pour but l’’évaluation
de l’exposition au bruit des populations et la mise en œuvre de politiques visant à réduire le niveau
d’exposition et à préserver des « zones calmes »
Concernant la gestion des déchets, le Syndicat de Traitement des Ordures Ménagères du Jura (SY-
DOM) prend en charge le traitement des déchets à l’échelle de la CA ECLA via deux infrastructures
principales :
• une unité de valorisation des déchets et de production d’énergies électrique et thermique. En 2021,
80% des déchets ménager collectés ont été incinérés à Lons-le-Saunier,
• un centre de stockage.
Depuis 2022, on observe une diminution du tonnage de déchet de 7%, ce qui est très encourageant
mais encore jugé comme insuffisant. L’enjeu est de continuer les efforts de réduction des déchets, de
veiller à répondre au besoin de collectes et d’encourager le développement du compostage. Pour
les déchetteries, l’enjeu est de continuer les efforts de recyclage et de réemploi.
Enfin, on dénombre 5 sites BASOLS sur le territoire (sols pollués) qui sont pour la plupart d’anciens sites
industriels. Les 5 sites identifiés ont tous fait l’objet de travaux de dépollution et de restauration, mais
contiennent toujours des concentrations de polluants supérieures aux normes attendues. Treize éta-
blissements pollueurs ont également été identifiés sur le territoire, dont 4 fromageries, une exploitation
de gravières et sablières ainsi que 3 entreprises de collecte de déchets, dont une qui est le site de sto -
ckage de déchets dangereux Chimirec Centre-Est.
6.1.1 Les nuisances et pollutions et le climat
La pollution de l’air et le changement climatique sont deux problématiques étroitement liées, notam -
ment de par leurs sources anthropiques communes et leur interdépendance. Ils sont tous deux majori-
tairement issus de la combustion d’énergies fossiles telles que le charbon, le pétrole ou le gaz, utilisés
comme sources énergétiques dans les secteurs de l’habitat, du tertiaire, de l’agriculture, de l’industrie
et du transport routier.
Mosaïque Environnement – 2025 P a g e | 28
Atouts Faiblesses
o Un territoire peu exposé au nuisance mis à part sonores
o Des nuisances sonores connues et faisant l’objet d’une
cartographie de bruit et d’un plan de prévention du
bruit dans l’environnement
o Des sites BASOLS faisant l’objet de mesure de
restauration
o Une diminution du tonnage des déchets produits
annuellement
o 5 sites et sols pollués ou
potentiellement pollués
o Une part non négligeable du
territoire exposé au bruit
o Des grands axes routiers
concentrés autour de Lons-le-
Saunier ÉTAT INITIAL DE L’ENVIRONNEMENT – PCAET
Par ailleurs, l’ozone est un polluant estival directement lié aux activités humaines et au rayonnement
solaire. En ce sens, une hausse des températures et de l’ensoleillement pourrait avoir un impact sur le
niveau moyen d’ozone et par là même le nombre d’épisodes de pollution à l’ozone. Outre l’impact
sanitaire, ce phénomène pourrait contribuer à diminuer le rendement des cultures et accroître l’effet
de serre.
Un réchauffement global est également favorable à l’implantation d’espèces exotiques envahis-
santes, et à la prolifération de certains allergènes qui pourraient devenir une nuisance pour la santé
publique. Le site Natura 2000 des Côtes de Mancy est déjà soumis à une pression en lien avec la proli-
fération de plusieurs espèces exotiques envahissantes.
6.1.2 Nuisances, pollutions et santé
Même dans un territoire majoritairement naturel comme l’Agglomération de Lons le Saunier, cer-
taines nuisances environnementales peuvent impacter la santé et la qualité de vie.
Le bruit, notamment lié à la circulation routière (vallées fréquentées, routes de stations, passages de
poids lourds), aux activités touristiques ou à certaines installations industrielles (carrières, équipements
de remontées mécaniques), est perçu comme l’une des principales atteintes à la qualité de l’envi -
ronnement. L’OMS reconnaît aujourd’hui ses effets sanitaires comme un enjeu majeur de santé pu -
blique : troubles du sommeil, stress, anxiété, fatigue chronique ou effets cardiovasculaires, particuliè-
rement en cas d’exposition prolongée.
Concernant la pollution des sols, les risques sanitaires sont difficilement quantifiables, mais existent. Ils
concernent surtout les zones anciennement exploitées, industrielles ou agricoles (anciens sites miniers,
stations-service, zones d’enfouissement, épandages), et peuvent entraîner une contamination indi-
recte par ingestion de produits issus de sols pollués, ou directe par inhalation de particules.
La gestion des déchets est un autre enjeu sanitaire, notamment du fait de l’éloignement de certains
sites de traitement, de la fréquentation saisonnière élevée, ou de la topographie qui peut rendre
complexe la collecte. Le risque sanitaire dépend des pratiques :
- Stockage ou enfouissement : risque par inhalation ou ingestion d’eau ou aliments contaminés
si les protections sont insuffisantes ;
- Incinération : émissions atmosphériques potentiellement nocives ;
- Traitement biologique (compostage, méthanisation) : risques d’inhalation de poussières ou de
micro-organismes.
Dans un contexte montagnard à forte qualité environnementale, la maîtrise de ces nuisances reste
essentielle pour préserver la santé des habitants comme celle des nombreux visiteurs.
Mosaïque Environnement – 2025 P a g e | 29 ÉTAT INITIAL DE L’ENVIRONNEMENT – PCAET
6.1.3 Enjeux et fil de l’eau
Enjeux Priorité État actuel Tendanc e Facteurs d’évolution
La limitation de l’exposition des populations et des
espaces au bruit par la réduction des
déplacements, l’anticipation et la prise en compte
des nuisances sonores potentiellement liées à
l’implantation d’éoliennes et aux travaux
d’amélioration des performances thermiques du
bâti, la mise en œuvre d’actions coordonnées avec
le climat (autobus silencieux et non polluants, bâti
à énergie positive et soucieux du confort
acoustique des occupants, espaces verts apaisants
pour l’ambiance citadine et bénéfiques pour le
climat, etc.)
Réglementations strictes et avancées
technologiques des modes de transport
Programmes & Stratégies en cours,
contribuant à répondre aux enjeux :
PPBE en place sur le territoire et zone de nuisance
bien identifiée
L’intégration de la connaissance des sols pollués
dans l’anticipation des projets et des changements
d’usages (remobilisation de sites potentiellement
pollués comme alternative à la consommation de
nouvelles surfaces, et donc de puits carbone, sous
réserve d’une dépollution garantissant la qualité
sanitaire, prise en compte la gestion durable des
eaux pluviales et ne pas préconiser l’infiltration
pour les secteurs les plus pollués)
Réduction à la source des pollutions
industrielles et agricoles du fait de la
réglementation
Politique de reconquête des friches avec
dépollution préalable
Intégration des Secteurs d’Information sur les
Sols dans les documents d’urbanisme
Programmes & Stratégies en cours,
contribuant à répondre aux enjeux :
Mesure de dépollution déjà engagée sur les sites
BASOLS
La poursuite des efforts pour atteindre les objectifs
du Grenelle et de la Loi de Transition Énergétique
pour la Croissance Verte (TECV) (réduction de la
production, développement du réemploi et du
recyclage, valorisation énergétique des déchets
ménagers, boues de STEP, déchets d’activités
agricoles, limitation de la mise en décharge et de
l’incinération …)
Tendance constatée à la réduction des
volumes de déchets sur le territoire
Programmes & Stratégies en cours,
contribuant à répondre aux enjeux :
Élaboration du schéma régional des carrières (SRC)
qui devrait améliorer la gestion des déchets inertes
du BTP
Réemploi des déchets pour la production d’énergie
Offrir à tous un environnement favorable à la santé
et un cadre de vie de qualité
Prise en compte croissante des enjeux santé-
environnement
Allongement de la période de pollinisation
des espèces allergènes
Migration des espèces envahissantes et/ou
vecteurs de maladies
Lutte contre les Espèces Exotiques Envahissantes
Mosaïque Environnement – 2025 P a g e | 30 Enjeux de réduction des nuisances
Légende
La limitation de l'exposition au bruit routier,
un enjeu à couplet avec la qualité de l'air
et les mobilités
Les activités locales, sources de pollutions à limiter
et contrôler, mais aussi à valoriser et mobiliser
dans la transition
* Les entreprises ICPE (?)
@ Lessites pollués, potentiels lieux
d'implantation de production d'ENR
La gestion des déchets comme une ressource locale
D Une démarche d'économie circulaire locale
#* L'unité de valorisation énergétique et le centre de tri,
deux équipements clefs de la gestion des déchets
Une réduction globale de la production
de déchets à poursuivre
Source : OSCGE 2017 - Pays Lédonien - DDT 39
Fond : © Contributeurs d'OpenStreetMap
Réalisation : 03/04/2025 - ED
Echelle : 1:115 000
LL
0 1 2km
Évaluation environementale du PCAET
Espace Communautaire Lons Agglomération (39)
MOSAÏQUE 22 ENVIRONNEMENT
Conseil & Expertise
ÉTAT INITIAL DE L’ENVIRONNEMENT – PCAET
Carte 6 : Enjeux de réduction des nuisances
Mosaïque Environnement – 2025 P a g e | 31 ÉTAT INITIAL DE L’ENVIRONNEMENT – PCAET
6.1.3.1.1 A retenir
Les enjeux liés à la réduction des nuisances et des pollutions sont en lien avec les enjeux de transition
énergétique. Ainsi, l’évolution des modes de transport et la réduction de la part de la voiture permet -
tra de limiter les nuisances sonores, le long des grands axes routiers, mais également dans le centre
urbain de l’espace communautaire même si cela n’est pas identifié dans le PPBE.
Enjeux : La limitation de l’exposition des populations et des espaces au bruit par la réduction des dé -
placements, l’anticipation et la prise en compte des nuisances sonores
La valorisation des déchets déjà engagée sur le territoire doit permettre de répondre à des besoins
de production d’énergie (ici avec l’unité de valorisation énergétique) ou de production d’alterna -
tives moins polluantes et limitant l’extraction de nouvelles ressources (ex. production de compost, dé-
veloppement des filières de réemploi). ECLA dispose à ce titre d’un réseau de déchetteries qu’elle
mobilise avec des espaces de réemploi.
Enjeux : La poursuite des efforts pour atteindre les objectifs du Grenelle et de la Loi de Transition Éner -
gétique pour la Croissance Verte
Enfin, les secteurs de sites pollués ou dégradés peuvent trouver une valorisation dans la production
d’énergie renouvelable, par l’installation de panneaux photovoltaïque ou l’accueil d’unités de pro-
ductions (méthaniseur, chaufferie collective, etc.). Le territoire de Lons-le-Saunier dispose ainsi de plu-
sieurs sites pouvant être étudiés (5 sites BASOLS).
Enjeux : L’intégration de la connaissance des sols pollués dans l’anticipation des projets et des chan -
gements d’usages
Enjeux : Offrir à tous un environnement favorable à la santé et un cadre de vie de qualité
Le contexte de réchauffement climatique et la déprise agricole favorise l’implantation et la proliféra-
tion d’espèces exotiques envahissantes. Ces espèces perturbent les écosystèmes locaux, et peuvent
provoquer des nuisances, comme certaines plantes allergènes.
Enjeux : Lutter contre les Espèces Exotiques Envahissantes
Mosaïque Environnement – 2025 P a g e | 32 Ressources Consommation d'espace
foncières Satisfaction des besoins en matériaux ; Développement de filières de recyclage de matériaux
Paysage & La préservation de la diversité et de la qualité des identités et valeurs paysagères
Patrimoine La conciliation du patrimoine architectural et du développement durable
Biodiversité
La préservation des continuités écologiques et de la biodiversité
La préservation et le renforcement de la nature ordinaire
Ressources en
eau
La préservation et la restauration des milieux aquatiques et humides (qualité, quantité)
La prise en compte du cycle de l'eau dans le développement urbain
La protection de la ressource en eau et la sécurisation des usages de l'eau (qualité, quantité)
Nuisances et
pollutions
La limitation de l'exposition des populations ef des espaces au bruit
L'intégration de la connaissance des sols pollués dans l'anticipation des projets et des changements
d'usages
Réduction et valorisation des déchets
Risques majeurs
Limiter l'apparition de risques encore peu présents, se développant grâce au changement climatique
La réduction de la vulnérabilité du territoire face à l'amplification des risques naturels par le changement
climatique
L'intégration du risque technologique comme composante de l'aménagement
Santé
environnement
Offrir à tous un environnement favorable à la santé et un cadre de vie de qualité
Lutte contre les Espèces Exotiques Envahissantes
ÉTAT INITIAL DE L’ENVIRONNEMENT – PCAET
Synthèse des enjeux du territoire
Mosaïque Environnement – 2025 P a g e | 33